F26.033CN - SERVEIS DE CONSTRUCCIÓ DE LLIBRERIES I SEQÜENCIACIÓ DIRECTA D’RNA MITJANÇANT TECNOLOGIA NANOPORE PER AL PROJECTE A-20621 DE LA FUNDACIÓ DE RECERCA CLÍNIC BARCELONA – INSTITUT D’INVESTIGACIONS BIOMÈDIQUES AUGUST PI I SUNYER

Serveis de construcció i seqüenciació de llibreries mitjançant tecnologia de seqüenciació directa d’ARN (Direct RNA sequencing), per aproximadament 100 mostres, en el marc del Projecte de Recerca A-20621 “M6A RNA MODIFICATIONS IN HUNTINGTON’S DISEASE: MECHANISMS AND STRATEGIES TO REGULATE HTT1A EXPRESSION” de la Fundació de Recerca Clínic Barcelona – Institut d’Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (FRCB-IDIBAPS). Els serveis inclouen la recepció de mostres, control de qualitat (QC), preparació de llibreries i seqüenciació directa d’RNA en plataforma PromethION, així com la generació i lliurament dels fitxers de dades i informes de control de qualitat, sense incloure anàlisi bioinformàtica interpretativa, de mostres provinents de models murins de la malaltia de Huntington, línies cel·lulars de ratolí, i neurones diferenciades a partir de cèl·lules mare pluripotents induïdes (iPSC), proporcionades per CHDI. L’objecte del present contracte consta d’un únic Lot: - LOT 1: Construcció de llibreries i seqüenciació directa d’ARN mitjançant tecnologia Nanopore (Direct RNA sequencing) Obligatorietat de licitar a tot el Lot sencer.

• Qualitat: increment d’experiència específica en Direct RNA Sequencing ONT per sobre de l’exigida com a solvència
  15%
• Capacitat logística i temps de recollida de mostres
  10%
• Criteris de valoració sotmesos a judici de valor
  N/A
• Millora dels terminis d’execució
  15%
• Robustesa del control de qualitat (QC) ofert
  15%
• Garanties i termini de repetició del servei sense cost
  10%
• Rendiment tècnic ofert a la plataforma PromethION
  15%
• Preu
  20%

• Altres condicions d'execució

  El compliment de la inexistència de relació econòmica i/o financera il·legal amb un país considerat paradís fiscal. S’acreditarà amb l’aportació de la declaració responsable que es troba a l’Annex 7 del PCAP.

• Instal·lacions tècniques

  Altres (Mínimo: • Disposar d’un laboratori adequadament equipat per a la preparació de llibreries, manipulació de material biològic i seqüenciació d’ARN d’alta complexitat, amb instruments idonis per al control de qualitat, la quantificació i l’anàlisi molecular de mostres d’RNA. • El laboratori on es realitzin les activitats de preparació de mostres, control de qualitat i seqüenciació directa d’RNA (Direct RNA Sequencing) mitjançant tecnologia Oxford Nanopore Technologies (PromethION) haurà de disposar d’una acreditació vigent conforme a la norma ISO/IEC 17025:2017, o d’un sistema de qualitat equivalent que acrediti competència tècnica en anàlisi molecular, processos d’assaig o validació de mètodes. La norma o sistema aportat haurà de garantir, com a mínim: o traçabilitat completa de mostres i reactius, o calibratge i manteniment de l’equipament científic, o aplicació de procediments normalitzats de treball (SOP), o registre i control de qualitat analítica en totes les fases del procés.)

• Condicions especials tipus Social

  Que durant l'execució del contracte l'empresa adjudicatària estableixi mesures que afavoreixin la conciliació de la vida laboral amb la familiar de les persones que intervenen en l'execució del contracte, que poden ser: adequació d'horaris dels col·legis, teletreball, suport econòmic per a sufragar despeses d'escoles infantils o centres d'atenció a persones dependents, etc...

• Personal tècnic o unitats tècniques

  Altres (Mínimo: a) Responsable tècnic/a del servei: Requisits mínims: - Titulació universitària en ciències (Biologia, Bioquímica, Biotecnologia, Genètica o titulacions equivalents). - Experiència mínima de 3 anys en maneig i preparació de mostres per a seqüenciació longread o RNAseq. - Participació demostrable en projectes de seqüenciació amb tecnologia Oxford Nanopore Technologies (ONT). b) Tècnic/a de laboratori amb experiència en ONT Requisits mínims: - Formació específica en tècniques de laboratori biològic, equivalent com a mínim a un Cicle Formatiu de Grau Superior en Laboratori Clínic i Biomèdic o titulació similar. - Experiència mínima d' 1 any en els últims 3 anys en tasques de: • preparació de llibreries ONT (Direct RNA, Direct cDNA, Whole Transcriptome), • maneig de fluxos PromethION, • control de qualitat previ i posterior a la seqüenciació.)

• Altres

  Declaració responsable del volum de negocis global de l’empresa (Mínimo: El volum global anual de negocis de l’empresa licitadora haurà de ser, com a mínim, de 100.000 €, import que correspon a 1,5 vegades el valor anual mitjà del contracte, calculat sobre una durada de 23 mesos i un pressupost base de licitació de 127.429,00 €.)

• Maquinària, material i l’equip tècnic a disposició

  Declaració maquinaria, material i equip tècnic a disposició (Mínimo: Maquinaria mínima: • Disposar de l’equip Promethion 24 o 48 d’Oxford Nanoper Technology • Programari MinKNOW i eines ONT actualitzades. • Equipament de QC: fluorímetre, bioanalitzador o equivalent. • Sistemes d'emmagatzematge segur d'alta capacitat (≥ 50 TB). )

• Assegurança de responsabilitat civil per riscos professionals

  Altres (Mínimo: Import igual o superior a 200.000 euros. )

• Relació serveis o treballs efectuats de la mateixa naturalesa en el curs de com a màxim els últims tres anys

  Certificats o declaracions de bona execució (Mínimo: Mínim a acreditar: - Els licitadors hauran d’acreditar que durant els tres últims exercicis han realitzat com a mínim 2 serveis complets de preparació de llibreries d’RNA poliA o RNA total destinats a seqüenciació directa d’RNA (Direct RNA Sequencing) amb tecnologia Oxford Nanopore Technologies (ONT). Cada servei haurà d’incloure, com a mínim: a) Preparació completa de llibreries per a Direct RNA Sequencing (dRNA-seq), seguint els protocols oficials d’ONT (també s’acceptarà experiència en GridION o en PromethION, atès que es tracta de la mateixa tecnologia i el mateix protocol experimental, variant únicament la capacitat de seqüenciació). b) Processament i control de qualitat de mostres d’RNA • Quantificació fluorimètrica. • Control d’integritat (RIN/RQN, DV200). • Preparació per a RNA poliA i/o RNA total, inclosa poliadenilació enzimàtica o depleció prèvia (quan correspongui). c) Preparació de llibreries llestes per a càrrega en plataformes ONT compatibles (GridION o PromethION) • Tant per a RNA poliA com per a RNA total. • Incloent totes les fases del flux experimental requerit per ONT. Requisit econòmic mínim: Cada servei haurà de tenir un import mínim de 5.000 € (sense IVA).)